國內醫師學生員額管制近日再掀波瀾。11個基層醫師團體27日聯合發表聲明，強烈反對教育部於今年6月核准清華大學、中興大學及中山大學三所大學的學士後醫學系，將原本以公費生身份設立的名額改為自費一般生，且將招生名額從原本的23人增加至35人。這一決定未經廣泛協商，令醫界基層大感不滿。

衛生福利部對此表示，教育部遇此問題時曾來函徵詢衛福部意見，衛福部明確表達盼維持既有1300名自費醫學生員額上限的立場；但主管機關最終屬教育部，如果其決意調整員額，衛福部只能尊重。對此，11個基層醫師相關團體，包括台北市、新北市、台南市、基隆市、桃園市、宜蘭縣、新竹市等地的醫師公會，以及台灣家庭醫學醫學會、中華民國基層醫療協會、中華民國基層醫師協會、中華民國診所協會全國聯合會，共同批評教育部此舉已逾越醫學生總量管制原則。

近日對醫學生員額爭議的關鍵在於，此次調整將使醫學生供給人數逼近1600人，遠超現行自費1300名及公費加僑生、海外生約1400人的格局。醫界基層認為，台灣醫師人力問題並非數量不足而是分布不均，偏鄉及基層醫療資源短缺，並非僅靠增加學生人數能夠解決，反而可能影響醫療服務體系的穩定及醫學教育品質。他們提醒，南韓過去有醫學生擴大招生導致醫療亂象的例子，台灣不應重蹈覆轍。

衛福部醫事司呂念慈指出，清華、中興、中山三校的學士後醫學系原本是配合「重點科別培育公費醫師制度計畫（第二期）」設定公費生名額，該計畫只推動至114學年度（2025年），今年度聯招及推甄仍編列相關經費，但到115學年度（2026年）計畫結束後，就不再有公費生名額。三校今後的招生模式及員額分配，需自作調整及思考。

呂念慈強調，教育部曾就此議題與衛福部討論，衛福部始終主張維持醫學生員額總量不變，如需調整，應與其他設有醫學系的大學協商。然而，教育部在三月來函表示將自行調整，衛福部於四月明確回復「表示尊重」，重申維持上限立場，但最終權限仍屬教育部。

此事引發醫界基層團體聯手抗議，認為政策方向需大幅檢討，單純擴張醫學生名額只會徒增醫療現場困境，呼籲主管機關保障醫學品質與醫療體系穩定，確保分布均衡與資源合理調配。